Poète et librettiste, Giovanni Filippo Apolloni a d'abord travaillé à Innsbruck au service de l'archiduc Ferdinand-Charles d'Autriche, puis à partir de 1660 à Rome pour le cardinal Flavio Chigi. Il était aussi membre de l'Accademia dei Percossi, cercle littéraire florentin réuni autour du poète satiriste Salvator Rosa.

Il a collaboré avec de nombreux musiciens, notamment avec Alessandro Melani, Bernardo Pasquini, Pietro Simone Agostini, Antonio Masini, comme librettiste pour leurs opéras ou leurs oratorios. Il a coécrit avec Filippo Acciaiuoli le Novello Giasone et il a mis en vers son Empio punito (musique d'Alessandro Melani), première adaptation sur la scène musicale du motif de Don Juan repris au Burlador de Sevilla y convidado de piedra de Tirso de Molina (1630).